Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl17Q9CPR4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl17Q9CPR4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl17Q9CPR4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms