Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim34aQ99PP6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim34aQ99PP6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim34aQ99PP6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim34aQ99PP6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim34aQ99PP6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim34aQ99PP6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim34aQ99PP6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim34aQ99PP6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim34aQ99PP6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim34aQ99PP6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim34aQ99PP6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms