Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NsmfQ99NF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NsmfQ99NF2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NsmfQ99NF2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NsmfQ99NF2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NsmfQ99NF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NsmfQ99NF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NsmfQ99NF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms