Protein–RNA interactions for Protein: Q99N42

Tymp, Thymidine phosphorylase, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TympQ99N42 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TympQ99N42 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TympQ99N42 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TympQ99N42 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TympQ99N42 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TympQ99N42 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TympQ99N42 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TympQ99N42 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TympQ99N42 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TympQ99N42 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TympQ99N42 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TympQ99N42 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TympQ99N42 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TympQ99N42 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TympQ99N42 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TympQ99N42 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TympQ99N42 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TympQ99N42 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TympQ99N42 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TympQ99N42 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TympQ99N42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TympQ99N42 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms