Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap3Q99LM2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk5rap3Q99LM2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk5rap3Q99LM2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5rap3Q99LM2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5rap3Q99LM2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms