Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcbtb2Q99LJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcbtb2Q99LJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcbtb2Q99LJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rcbtb2Q99LJ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms