Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snx18Q91ZR2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snx18Q91ZR2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snx18Q91ZR2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms