Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpe65Q91ZQ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpe65Q91ZQ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpe65Q91ZQ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpe65Q91ZQ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpe65Q91ZQ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpe65Q91ZQ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpe65Q91ZQ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpe65Q91ZQ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpe65Q91ZQ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms