Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms