Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde6cQ91ZQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde6cQ91ZQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde6cQ91ZQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms