Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acsl6Q91WC3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acsl6Q91WC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acsl6Q91WC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Acsl6Q91WC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsl6Q91WC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms