Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan3Q91VW9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan3Q91VW9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zkscan3Q91VW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zkscan3Q91VW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan3Q91VW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan3Q91VW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan3Q91VW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms