Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam3cQ91VU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam3cQ91VU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam3cQ91VU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam3cQ91VU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam3cQ91VU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms