Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SelenomQ8VHC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SelenomQ8VHC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SelenomQ8VHC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SelenomQ8VHC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms