Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn4Q8VCH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn4Q8VCH8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn4Q8VCH8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn4Q8VCH8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn4Q8VCH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms