Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC1

Hpgd, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdQ8VCC1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HpgdQ8VCC1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HpgdQ8VCC1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HpgdQ8VCC1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HpgdQ8VCC1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HpgdQ8VCC1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpgdQ8VCC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HpgdQ8VCC1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HpgdQ8VCC1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms