Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc9Q8VC31 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc9Q8VC31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc9Q8VC31 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc9Q8VC31 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc9Q8VC31 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms