Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup58Q8R332 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup58Q8R332 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup58Q8R332 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup58Q8R332 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup58Q8R332 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms