Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b4Q8QZY9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b4Q8QZY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b4Q8QZY9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms