Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Otud6bQ8K2H2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Otud6bQ8K2H2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Otud6bQ8K2H2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Otud6bQ8K2H2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Otud6bQ8K2H2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Otud6bQ8K2H2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Otud6bQ8K2H2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms