Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Setd1bQ8CFT2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Setd1bQ8CFT2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Setd1bQ8CFT2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Setd1bQ8CFT2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Setd1bQ8CFT2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Setd1bQ8CFT2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Setd1bQ8CFT2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Setd1bQ8CFT2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Setd1bQ8CFT2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setd1bQ8CFT2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Setd1bQ8CFT2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Setd1bQ8CFT2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Setd1bQ8CFT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms