Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc63Q8CDV6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc63Q8CDV6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc63Q8CDV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc63Q8CDV6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc63Q8CDV6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc63Q8CDV6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc63Q8CDV6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc63Q8CDV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc63Q8CDV6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms