Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lrrc9Q8CDN9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lrrc9Q8CDN9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Lrrc9Q8CDN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lrrc9Q8CDN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lrrc9Q8CDN9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Lrrc9Q8CDN9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrrc9Q8CDN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lrrc9Q8CDN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms