Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Podxl2Q8CAE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Podxl2Q8CAE9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Podxl2Q8CAE9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Podxl2Q8CAE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Podxl2Q8CAE9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Podxl2Q8CAE9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Podxl2Q8CAE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms