Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc15Q8C9M2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc15Q8C9M2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc15Q8C9M2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc15Q8C9M2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc15Q8C9M2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms