Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

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Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf21bQ8C966 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf21bQ8C966 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf21bQ8C966 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf21bQ8C966 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf21bQ8C966 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf21bQ8C966 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms