Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp20Q8C6M1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp20Q8C6M1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp20Q8C6M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp20Q8C6M1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp20Q8C6M1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp20Q8C6M1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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