Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam53cQ8BXQ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam53cQ8BXQ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam53cQ8BXQ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam53cQ8BXQ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam53cQ8BXQ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam53cQ8BXQ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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