Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dclk3Q8BWQ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dclk3Q8BWQ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dclk3Q8BWQ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dclk3Q8BWQ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dclk3Q8BWQ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclk3Q8BWQ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk3Q8BWQ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms