Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scfd2Q8BTY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scfd2Q8BTY8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scfd2Q8BTY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scfd2Q8BTY8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scfd2Q8BTY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scfd2Q8BTY8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms