Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sfr1Q8BP27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sfr1Q8BP27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sfr1Q8BP27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfr1Q8BP27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfr1Q8BP27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms