Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hirip3Q8BLH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hirip3Q8BLH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hirip3Q8BLH7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hirip3Q8BLH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hirip3Q8BLH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hirip3Q8BLH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hirip3Q8BLH7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hirip3Q8BLH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hirip3Q8BLH7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hirip3Q8BLH7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms