Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcal1Q8BJL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcal1Q8BJL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarcal1Q8BJL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcal1Q8BJL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms