Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rspo4Q8BJ73 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rspo4Q8BJ73 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rspo4Q8BJ73 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rspo4Q8BJ73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rspo4Q8BJ73 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rspo4Q8BJ73 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms