Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra5Q8BHJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra5Q8BHJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms