Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Npas4Q8BGD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Npas4Q8BGD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Npas4Q8BGD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npas4Q8BGD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npas4Q8BGD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Npas4Q8BGD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms