Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc155Q80VJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc155Q80VJ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc155Q80VJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc155Q80VJ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc155Q80VJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc155Q80VJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms