Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mcph1Q7TT79 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mcph1Q7TT79 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mcph1Q7TT79 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mcph1Q7TT79 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mcph1Q7TT79 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Mcph1Q7TT79 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mcph1Q7TT79 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mcph1Q7TT79 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mcph1Q7TT79 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mcph1Q7TT79 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms