Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamp3Q7TST5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamp3Q7TST5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lamp3Q7TST5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lamp3Q7TST5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms