Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Kcnf1Q7TSH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Kcnf1Q7TSH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Kcnf1Q7TSH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Kcnf1Q7TSH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Kcnf1Q7TSH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms