Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stambpl1Q76N33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stambpl1Q76N33 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stambpl1Q76N33 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stambpl1Q76N33 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stambpl1Q76N33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms