Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl3Q6W5C0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl3Q6W5C0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl3Q6W5C0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cxcl3Q6W5C0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcl3Q6W5C0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcl3Q6W5C0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms