Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx13Q6PHS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Snx13Q6PHS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx13Q6PHS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx13Q6PHS6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx13Q6PHS6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx13Q6PHS6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms