Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC9

Zfp341, Zinc finger protein 341, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp341Q6PGC9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp341Q6PGC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp341Q6PGC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp341Q6PGC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp341Q6PGC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp341Q6PGC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp341Q6PGC9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp341Q6PGC9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp341Q6PGC9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms