Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dtx4Q6PDK8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dtx4Q6PDK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dtx4Q6PDK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dtx4Q6PDK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms