Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd13aQ6PDE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd13aQ6PDE8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms