Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb4Q6P8W9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb4Q6P8W9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmgb4Q6P8W9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgb4Q6P8W9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgb4Q6P8W9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgb4Q6P8W9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms