Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PrimpolQ6P1E7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PrimpolQ6P1E7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PrimpolQ6P1E7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PrimpolQ6P1E7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrimpolQ6P1E7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms