Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV72

Wdcp, WD repeat and coiled-coil-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WdcpQ6NV72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WdcpQ6NV72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WdcpQ6NV72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WdcpQ6NV72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WdcpQ6NV72 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WdcpQ6NV72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
WdcpQ6NV72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms