Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSV7

Fam149b1, Protein FAM149B1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam149b1Q6NSV7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam149b1Q6NSV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam149b1Q6NSV7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam149b1Q6NSV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam149b1Q6NSV7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam149b1Q6NSV7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms