Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms